El presidente Jefferson esperaba que Lewis tomara las notas en bruto y los mapas de su viaje y los convirtiera en un relato "científico" pulido que pudiera ser utilizado por otros exploradores y, más tarde, por los colonos. Lewis, sin embargo, hizo pocos avances en esta tarea antes de su prematura muerte en 1809. Por lo tanto, la mayor parte del trabajo en los diarios y mapas recayó en Clark, quien había sido nombrado gobernador del territorio de Missouri. Desde su oficina en St. Louis, Clark compiló y editó sus diarios y mapas, incluido un mapa de todo su viaje desde el Mississippi hasta el Pacífico.
El mapa de Clark era importante. Cientos de comerciantes de pieles empleados por la empresa de Clark consultarían su mapa antes de partir. Y a medida que se montaban nuevas expediciones para explorar otras regiones del Oeste, los exploradores se detenían y aprendían del mapa de Clark.
A su vez, cuando regresaban al Este, los comerciantes, cazadores, exploradores e incluso la gente indígena le brindaban nueva información a Clark. Usaría esa información para actualizar su mapa maestro del Oeste. En 1814, un editor de Philadelphia publicó una revista en dos volúmenes titulada:
Historia de la expedición bajo el mando de los capitanes Lewis y Clark
Incluía una versión grabada del mapa de Clark y se convirtió en una referencia estándar para los viajeros en los años venideros.
Otros exploradores como Pike, Long y Fremont mejoraron enormemente el conocimiento geográfico sobre el Oeste. Hicieron posible que los inmigrantes posteriores los siguieran.